Вести Науки: последние открытия, тенденции и мифы в области науки и техники.

Данные тысяч человеческих геномов будут храниться на Amazon.com

  • Автор  Волков Артем
Данные тысяч человеческих геномов будут храниться на Amazon.com
Американский Национальный Институт Здоровья объявил в эту пятницу (30 марта), что они намерены разместить данные из 1000 своих хранилищ человеческих Геномов на облачных серверах корпорации Amazon для бесплатного доступа к  ним. Эти 1000 Геномов - самая большая в мире база данных человеческой генетики. Она создавалось, чтобы служить как "банк человеческих генов" включая людей различных этнических принадлежностей во всем мире, и доступ к нему будет означать, что ученые со всего мира получат доступ ко всем главным генным факторам, по которым человечество изменяется генетически. Теперь, когда они размещены на серверах Amazon, данные тысячи Геномов будут доступными и более дешевыми для ученых, чтобы проанализировать их в научных целях.

"Облачный хостинг Amazon, делает данные доступнее для исследователей со всего мира. Такой подход является очень полезным, так как позволяет избежать ученым проблем, когда им приходится тратить драгоценное время и личные финансы на доступ к нужным данным и дальнейшее их хранение на специальных дорогостоящих серверах, которые при этом, ещё нужно найти в своем регионе». - пишет Эрик Шадт, директор исследования Генома в Mount Sinai School of Medicine в Нью-Йорке, в своем письме к электронному изданию InnovationNewsDaily. «Такой подход, несомненно, является наиболее предпочтительным на данный момент».

Несмотря на то, что в анонсе проекта фактически упоминается тысяча геномов, на самом деле на серверах уже хранится генетическая информация 1700 анонимных людей, и еще 900 готовят для добавления в этом году. Основная трудность с такой базой специфических данных  состоит в том, что она является чрезмерно большой — 200 терабайт, количество данных, которое заполнило бы 30 000 DVD дисков. Информация в базе данных была в свободном доступе и до этого, на сервере 1000genomes.org, но прежде, чем Amazon согласился на размещение, ученые должны были заплатить за пропускную способность интернета и место для хранения данных, для того чтобы начать изучать данные, объясняет Шадт. Исследователи, у которых не было доступа к мощным компьютерам, способным хранить данные 1000 Геномов, не могли воспользоваться данными вообще.

Веб-сервисы Amazon также предлагают ресурсы Суперкомпьютеров для работы с исследованиями, ученым которые хотят производить вычисления с огромной базой данных генетики, не приобретая мощных компьютеров. Однако, такую возможность Amazon уже сделает платной. Цена, за время такого объемного вычисления одним ученым, будет стоить приблизительно 1 300 долларов в час, как сообщает в своем отчете издание New York Times. Тем не менее, многие ученые сочтут что эти вычисления стоят такой цены. «Многие будут готовы понести такие расходы, потому что это намного дешевле чем, чем покупка устройства для пятиста терабайт дискового хранения и компьютерного процессора для возможности быстро проанализировать такие данные в местном масштабе» пишет Шадт.

Делая данные о геноме человека, более доступными для исследователей, нововведение Amazon, может, в конечном счете, помочь ученым предсказать болезни более достоверно, так как будут основываться на генетике человека, предполагает Шадт.

Кстати соглашение с Amazon - часть новой инициативы со стороны администрации Обамы, которая инвестирует $200 миллионов в исследования лучших способов хранения и анализа чрезвычайно больших наборов данных, таких как, например, 1000 Геномов.

Источник информации



Главной целью проекта является распространение научных знаний в современной и доступной форме. Наша команда опытных журналистов стремится к популяризации научного подхода к окружающей действительности и предлагает Вам ознакомиться с последними открытиями, тенденциями и мифами в области астрономии, биологии, медицины, физики, психологии и прикладных наук. Все права на материалы, находящиеся на сайте "Вести Науки", охраняются в соответствии с законодательством РФ, в том числе, об авторском праве и смежных правах. При любом использовании материалов сайта, гиперссылка (hyperlink) на VestiNauki.ru обязательна. ©VestiNauki.ru 2011-13

Top Desktop version